Partzuergoko organo nagusia da eta Batzorde Betearazlea bezala, kide anitzekoa.
Estatutuetan aurreikusitako eztabaidatze, erabakitze eta betearazte funtzioak betetzen ditu.
26 kidek osatzen dute, 13, Eusko Jaurlaritzakoak; 2, Bizkaiko Foru Diputaziokoak, eta 11, Metroko ibilbidea igarotzen den udalak ordezkatzen dituztenak. Idazkari nagusia ere Kontseilu Nagusiko kide da. Partzuergoko zuzendari kudeatzailea, Metro Bilbaoko zuzendari kudeatzailea eta kontu-hartzailea ere bertaratzen dira.
Kontseilu Nagusia gaur egun ondokoek osatzen dute:
KONTSEILU NAGUSIKO KIDE DIREN KONTSEILARIAK
Presidentea
Unai Rementeria Maiz
Bizkaiko diputatu nagusia
EUSKO JAURLARITZAKO ORDEZKARI DIREN MAHAIKIDEAK
Iván Pedreira Lanchas
Eusko Jaurlaritzako Garraio Plangintzaren Zuzendaria
Francisco Javier Seoane Ikaran
Eusko Trenbideak - Ferrocarriles Vascos, SAko zuzendari nagusia
Ernesto Martínez de Cabredo Arrieta
Euskal Trenbide Sareako zuzendari nagusia (ETS)
Yurdana Burgoa Valtierra
Eusko Jaurlaritzako, Kabinete eta Komunikazio Zuzendaria Ekonomia eta Ogasunaren Saila
María Dolores de Juan de Miguel
Eusko Jaurlaritzako Garraio Azpiegituraren zuzendaria.
Julián Ferraz Sumillera
Euskal Tranbide Sareako Plangintza eta Proiektu zuzendaria.
Luis Pedro Marco de la Peña
Eusko Jaurlaritzako Azpiegitura eta Garraio sailburuordea
Paloma Usatorre Mingo
Eusko Jaurlaritzako Zerbitzu Zuzendaria, Lurralde Plangintza, Etxebizitza eta Garraioen Saila
Hernando Lacalle Edeso
Eusko Jaurlaritzako Ekonomia, Finantza eta Aurrekontu Sailburuordea
Josu Iñaki Garay Ibáñez de Elejalde
Eusko Jaurlaritzako Finantza Politikako zuzendaria
Francisco Javier Arnáez Acerrigor
Eusko Jaurlaritzako Finantza Politikako Zuzendaria
Miguel de los Toyos Nazabal
Eusko Jaurlaritzako Lurralde Plangintzaren eta Hiri Agendaren sailburuordea
David Álvarez Martínez
Eusko Jaurlaritzako Ondare eta Kontratazioko zuzendaria
BIZKAIKO FORU ALDUNDIKO ORDEZKARI DIREN MAHAIKIDEAK
Miguel Angel Gómez Viar
Garraioak eta Mugikortasun Jasangarria Sustatzeko Foru diputatua
TOKI ERAKUNDEETAKO ORDEZKARI DIREN MAHAIKIDEAK
Ainhoa Basabe Meléndez
Sestaoko zinegotzia
Amaia Del Campo Berasategui
Basauriko alkatea
Aintzane Urkijo Sagredo
Santurtziko alkatea
Aitziber Oliban Gutierrez
Erandioko alkatea
Asier Iragorri Basaguren
Basauriko alkatea
Amaia Aguirre Muñoa
Getxoko alkatea
Nora Abete García
Bilboko zinegotzia
Juan María Aburto Rique
Bilboko alkatea
Mikel Torres Lorenzo
Portugaleteko alkatea
Loren Oliva Santamaria
Etxebarriko alkatea
Juan Carlos Martínez Llamazares
Leioako zenegotzia
2015ko Urriak 27.